พ.ศ. 2556 - 2560

สำนักงานคณบดีคณะแพทยศาสตร์และสำนักงานเลขานุการศูนย์วิทยาศาสตร์สุขภาพ (โรงพยาบาลมหาวิทยาลัยบูรพา) ย้ายสำนักงานมารวมกันที่อาคารสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาเมื่อปลายปี พ.ศ. 2555 ตามนโยบายการใช้ทรัพยากรให้เกิดประสิทธิภาพสูงสุด

ในปี พ.ศ. 2556 มีบัณฑิตแพทย์รุ่นที่ 1 จบการศึกษา และเป็นปีแรกที่คณะแพทยศาสตร์ส่งนิสิตแพทย์รุ่นที่ 4 จำนวน 16 คน ไปเรียนชั้นคลินิกที่โรงพยาบาลเจ้าพระยาอภัยภูเบศร

ในปี พ.ศ. 2559 สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี เสด็จพระราชดำเนินทรงประกอบพิธีวางศิลาฤกษ์อาคารวิจัยทางการแพทย์และทรงเปิดอาคารสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา

พ.ศ. 2561 - 2565

โรงพยาบาลมหาวิทยาลัยบูรณาขยายศักยภาพการบริการทางการแพทย์ในระดับตติยภูมิและเตรียมความพร้อมในการเป็นโรงเรียนแพทย์เพื่อรองรับการเรียนการสอนชั้นคลินิกของนิสิตแพทย์และการวิจัยตามนโยบายประเทศ คณะแพทยศาสตร์ปรับเปลี่ยนรูปแบบการปฏิบัติงานทั้งระบบการบริหารจัดการภายใน ระบบจัดการเรียนการสอนทั้งในระดับปรีคลินิก และชั้นคลินิก รวมถึงงานบริการทางการแพทย์ตามวิถีแบบ New Normal อันเนื่องจากสถาการณ์ของโรค covid-19

หลักสูตรแพทยศาสตรบัณฑิตผ่านการรับรองมาตรฐานการศึกษาแพทยศาสตร์ตามเกณฑ์มาตรฐานสากล และในปีการศึกษา 2565 คณะฯ ส่งนิสิตแพทย์ 32 คน เรียนชั้นคลินิกที่โรงพยาบาลสมเด็จพระปิ่นเกล้า กรมแพทย์ทหารเรือ เป็นรุ่นแรก

พ.ศ. 2566 - ปัจจุบัน

คณะแพทยศาสตร์ขยายความร่วมมือกับกรมแพทย์ทหารเรือด้วยการลงนามความร่วมมือกับโรงพยาบาลสมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ เพื่อเป็นสถาบันร่วมผลิตบัณฑิตแพทย์ รองรับการเพิ่มจำนวนนิสิตแพทย์อีก 24 คน (รวมเป็น 72 คน) และขยายศักยภาพด้านการวิจัย การบริการวิชาการ การบริการทางการแพทย์อย่างต่อเนื่อง

ในปี พ.ศ. 2568 แพทยสภาอนุมัติให้คณะฯ รับนิสิต เพิ่มอีก 16 คน (รวมเป็น 88 คน) โดย 4 คน เรียนชั้นคลินิกที่โรงพยาบาลเจ้าพระยาอภัยภูเบศร (รวมเป็น 20 คน) และ 12 คน เรียนชั้นคลินิกที่โรงพยาบาลมหาวิทยาลัยบูรพา